Die Mitglieder der GRÜNEN LIGA leisten aktiv regionale und überregionale fachbezogene Arbeit. Die Organisationsstruktur, die sich für überregionale Facharbeit herausgebildet hat, sind Bundeskontaktstellen und Facharbeitskreise. Die Bundeskontaktstellen vertreten den Verein fachlich nach außen und regen die fachliche Arbeit innerhalb des Vereins zu einem bestimmten Themenbereich an beziehungsweise koordinieren und unterstützen diese. Der Status Bundeskontaktstelle wird von der Mitgliederversammlung vergeben. Die Bundeskontaktstellen haben eine eigene Geschäftsordnung, die hier einsehbar ist.